1. 研究目的与意义
蛋白质组学是立足于蛋白质水平的研究，通过研究某一类型细胞、组织、体液中的所有蛋白质组成、功能及蛋白之间的相互作用以了解复杂的疾病（如癌症）的信号转导通路，疾病机制或蛋白-药物之间的相互作用等方面的重要信息。
肝癌是世界范围内常见恶性肿瘤，我国也是肝病大国，绝大部分原发性肝癌（70% - 90%）为肝细胞癌（HCC）。
在 HCC 发生发展过程中，蛋白质发挥了靶标和事件之间联系的功能，在临床使用的疾病生物标志物，蛋白质占 70% 以上，蛋白质浓度的变化或蛋白质翻译后状态的变化可以用作疾病生物标志物。
2. 文献综述
肿瘤细胞能量代谢特点及作用机制研究进展汤清涵 14药物制剂 048014133摘 要：正常细胞的能量主要来自糖酵解和线粒体的有氧氧化，细胞的活性和能量状态密切相关，恶性肿瘤由于其生长迅速，常常出现葡萄糖摄取量增高、糖酵解增加和乳酸堆积现象，针对肿瘤细胞能量代谢的研究受到了广泛的关注。
本文通过介绍肿瘤细胞对能源物质的利用和代谢机制及对调节能量代谢的有影响的因素，将有利于揭示肿瘤能量代谢改变与肿瘤发生发展之间的因果关联，为抗癌药物作用机理的阐明和针对能量代谢的靶向肿瘤治疗策略提供新的视野。
关键词 ：肿瘤能量代谢；Warburg 效应；糖酵解；线粒体氧化磷酸化；能源物质Resarch progress in the characteristics of Energy Metabolism and mechanism of tumor cell Abstract: The energy of normal cells is mainly derived from glycolysis and mitochondrial oxidative phosphorylation. The activity and energy status of cells are closely related. Because of their rapid growth, malignant tumors often have increased glucose uptake, increased glycolysis and accumulation of lactic acid. The study of energy metabolism, targeting tumor cells, has received extensive attention. This article describes the use of energy substances and metabolic mechanisms of tumor cells and describes the factors that can regulate energy metabolism. It will help to reveal the causal relationship between tumor energy metabolism and the development of tumors, clarifying the mechanism of anti-cancer drugs and providing a new perspective for cancer treatment strategies targeting energy metabolism. Key Words:Energy metabolism of tumer; Warburg effect; Glycolysis; Mitochondrial oxidative phosphorylation;Energy substance新陈代谢是机体生命活动的基本特征，包括物质代谢和能量代谢。
3. 设计方案和技术路线
研究方案：1. 通过 TMT 蛋白质组定量技术对蛋白表达进行全面分析，提取给药组和模型组的差异蛋白。
1) 给药和模型组瘤组织蛋白提取，用BCA 试剂盒测定提取蛋白浓度；2) SDS-PAGE评估蛋白质提取质量；3) 胰酶酶解并用TXY试剂盒标记肽段；4) LC-MS/MS检测和分析肽段含量；5) 二级质谱数据在Mus musculus 数据库（标准蛋白搜GST和MBP 库）中进行匹配，同时使用反库以排除假阳性率。
2. 通过 Uniprot 和 KEGG 数据库对筛得的差异蛋白进行生物信息学分析。
4. 工作计划
2022年1~2月 文献检索，学习代谢组学和蛋白质组学相关背景知识；2022年3月 整理蛋白质组数据，掌握数据库的使用；2022年4月 筛选出差异蛋白，对其进行生物信息学分析和通路富集；2022年5月 通过 PRM 技术对关键差异蛋白质进行验证；2022年6月 整理数据，撰写论文，毕业答辩。
5. 难点与创新点
特色：①初次对中药莪术及其醋制炮制品进行抗肝癌机制研究；②立足于蛋白质在肝癌发生发展机制层面的重要地位与作用，从定量蛋白质组的视角切入，关注肝癌蛋白质组变化规律，探寻肝癌治疗的突破口。
创新：据前期研究和已有文献的报道，肝癌组织中高表达蛋白质主要涉及糖酵解脂肪酸生物等合成途径，本课题着重于从能量代谢的角度，对生/醋莪术给药后发挥抑制癌细胞生长作用所调控的生物代谢途径做深入的阐释，为探索肝癌生物机制和治疗提供新的策略。
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